Меѓународната унија за зачувување на природата (IUCN) го зголеми степенот на загрозеност на царските пингвини за две категории, класифицирајќи ги како вид на кој му се заканува исчезнување. Главната причина е драматичното намалување на морскиот мраз на Антарктикот, што директно влијае врз нивниот опстанок.
Овие пингвини зависат од стабилен „фиксен“ морски мраз, каде што ги положуваат јајцата и ги одгледуваат пилињата во текот на поголемиот дел од годината. Но, поради глобалното затоплување, мразот се распаѓа сè порано, пред пилињата да развијат водоотпорно перје.
Кога тоа ќе се случи, цели колонии завршуваат во океанот, а пилињата се дават или замрзнуваат.
Особено алармантен беше случајот во 2022 година, кога четири од пет познати гнездилишта во Белингсхаузеновото Море колабираа, при што загинаа илјадници пилиња. Слични настани се регистрирани и во Веделовото Море уште во 2016 година.
Сегашната популација се проценува на околу 595.000 возрасни единки, но веќе е забележан пад од околу 10% во периодот од 2009 до 2018 година. Според прогнозите, ако трендот продолжи, бројот на царски пингвини може да се преполови до 2080-тите години.
Климатските промени не ги погодуваат само пингвините. Истражувањата покажуваат дека и популацијата на антарктичките морски лавови значително опаднала, главно поради намалената достапност на крил – нивна главна храна.
Дополнително, јужниот морски слон е погоден од епидемии на птичји грип, што доведе до масовно угинување на младенчиња во некои колонии.
Овие податоци укажуваат дека промените во климата веќе имаат сериозни последици врз цели екосистеми, а царските пингвини се меѓу најпогодените видови.