Почетоците на високото уметничко образование во Македонија се поврзани со потребата за систематско и академско насочување на талентираните млади уметници. Факултетот за ликовна уметност – Скопје е основан на 31 март, 1980 година со одлука на тогашните надлежни органи, како дел од напорите за создавање високообразовна институција посветена на уметноста. Како составен дел на Универзитетот „Св. Кирил и Методиј“, факултетот беше формиран три децении по основањето на самиот универзитет во 1949 година. Неговото создавање беше иницирано од д-р Тома Прошев, тогашен директор на Универзитетскиот центар за уметности во СР Македонија, кој препозна потреба од академска институција што ќе ги едуцира идните генерации на ликовни уметници.
За организацијата и структурирањето на новиот факултет беше формирана Матична комисија, предводена од Васко Поповски, потпретседател на Собранието на Град Скопје, и поддржана од истакнати професори и уметници како проф. д-р Борис Петковски, акад. Коста Ангели-Радовани, акад. Петар Мазев, акад. Богдан Боричин, акад. Миле Јовановиќ и проф. Илија Џувалековски. По нивниот избор, на 23 април 1980 година беа назначени првите наставници, меѓу кои академските сликари Петар Мазев, Димитар Кондовски, Родољуб Анастасов и Душан Перчинков (прв продекан), акад. вајар Петар Хаџи-Бошков (прв декан), акад. сликар и графичар Драгутин Аврамовски-Гуте. Со усвојување на наставните програми, факултетот официјално започна со работа на 16 јули 1980 година.
Наставата за првата генерација студенти започна во учебната 1980/81 година во просториите на Училиштето за применета уметност во Скопје, а една година подоцна, на 1 април 1981, факултетот беше регистриран како дел од Универзитетскиот центар за уметности. Во 1981 година, на наставниот кадар му се приклучија академски вајар м-р Стефан Маневски, акад. сликар Симон Шемов и акад. сликар и графичар м-р Димитар Малиданов.
Во 1982 година, ФЛУ доби сопствен простор за работа во културно-историскиот објект Сули-ан во Старата скопска чаршија. Со текот на времето, факултетот се разви во самостојна високообразовна институција, посветена на научно-истражувачка, стручна и уметничка дејност. Денес, ФЛУ работи во духот на академската автономија, поддржувајќи инклузивност и еднакви можности, согласно Законот за високо образование и универзитетските статути.